Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms