Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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