Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Hdac5Q9Z2V6 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Hdac5Q9Z2V6 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Hdac5Q9Z2V6 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 AC153512.2-201ENSMUST00000220363 1273 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Hdac5Q9Z2V6 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Hdac5Q9Z2V6 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Hdac5Q9Z2V6 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Hdac5Q9Z2V6 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms