Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms