Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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