Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Cldn9Q9Z0S7 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Cldn9Q9Z0S7 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Cldn9Q9Z0S7 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn9Q9Z0S7 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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