Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms