Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms