Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms