Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms