Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ04

Cops7a, COP9 signalosome complex subunit 7a, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7aQ9CZ04 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Cops7aQ9CZ04 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Cops7aQ9CZ04 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Cops7aQ9CZ04 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Cops7aQ9CZ04 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Cops7aQ9CZ04 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Cops7aQ9CZ04 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Cops7aQ9CZ04 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Cops7aQ9CZ04 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Cops7aQ9CZ04 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Cops7aQ9CZ04 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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Cops7aQ9CZ04 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Cops7aQ9CZ04 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cops7aQ9CZ04 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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