Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms