Protein–RNA interactions for Protein: Q8K352

Sash3, SAM and SH3 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash3Q8K352 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Sash3Q8K352 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Sash3Q8K352 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Sash3Q8K352 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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Sash3Q8K352 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Sash3Q8K352 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Sash3Q8K352 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sash3Q8K352 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Sash3Q8K352 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms