Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms