Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms