Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms