Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms