Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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