Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Nup37-202ENSMUST00000169309 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Ccl20-203ENSMUST00000186832 772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Ighv6-2-201ENSMUST00000192430 295 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 CT009494.1-201ENSMUST00000225121 1213 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 AC123735.1-201ENSMUST00000227358 605 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Olfr765-202ENSMUST00000216460 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 4933436E23Rik-201ENSMUST00000192824 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm5885-202ENSMUST00000203357 528 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm4290-201ENSMUST00000206897 814 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Kcne3-205ENSMUST00000207358 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm40646-201ENSMUST00000218243 490 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Glipr1-201ENSMUST00000074805 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Olfr1137-201ENSMUST00000099850 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ClmQ7TSN2 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms