Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms