Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Sox11Q7M6Y2 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox11Q7M6Y2 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox11Q7M6Y2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox11Q7M6Y2 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox11Q7M6Y2 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox11Q7M6Y2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox11Q7M6Y2 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox11Q7M6Y2 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox11Q7M6Y2 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox11Q7M6Y2 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox11Q7M6Y2 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox11Q7M6Y2 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Sox11Q7M6Y2 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox11Q7M6Y2 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Sox11Q7M6Y2 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox11Q7M6Y2 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox11Q7M6Y2 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Sox11Q7M6Y2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox11Q7M6Y2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox11Q7M6Y2 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox11Q7M6Y2 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox11Q7M6Y2 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox11Q7M6Y2 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox11Q7M6Y2 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox11Q7M6Y2 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox11Q7M6Y2 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox11Q7M6Y2 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox11Q7M6Y2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox11Q7M6Y2 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox11Q7M6Y2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Sox11Q7M6Y2 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sox11Q7M6Y2 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sox11Q7M6Y2 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox11Q7M6Y2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox11Q7M6Y2 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox11Q7M6Y2 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sox11Q7M6Y2 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sox11Q7M6Y2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sox11Q7M6Y2 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sox11Q7M6Y2 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sox11Q7M6Y2 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox11Q7M6Y2 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox11Q7M6Y2 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox11Q7M6Y2 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox11Q7M6Y2 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox11Q7M6Y2 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox11Q7M6Y2 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox11Q7M6Y2 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox11Q7M6Y2 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox11Q7M6Y2 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox11Q7M6Y2 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox11Q7M6Y2 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox11Q7M6Y2 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox11Q7M6Y2 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox11Q7M6Y2 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox11Q7M6Y2 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox11Q7M6Y2 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox11Q7M6Y2 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox11Q7M6Y2 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox11Q7M6Y2 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox11Q7M6Y2 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox11Q7M6Y2 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox11Q7M6Y2 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox11Q7M6Y2 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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