Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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