Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm29593-201ENSMUST00000189827 620 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
AtrxQ61687 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Gm9578-201ENSMUST00000182354 753 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Gm15831-201ENSMUST00000156195 516 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Gm12499-201ENSMUST00000121961 546 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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