Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms