Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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DbpQ60925 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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DbpQ60925 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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DbpQ60925 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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DbpQ60925 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
DbpQ60925 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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