Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf123Q5XPI3 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf123Q5XPI3 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf123Q5XPI3 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf123Q5XPI3 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf123Q5XPI3 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf123Q5XPI3 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf123Q5XPI3 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf123Q5XPI3 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf123Q5XPI3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf123Q5XPI3 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf123Q5XPI3 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf123Q5XPI3 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms