Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 AC114585.2-201ENSMUST00000227693 486 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 BC048562-201ENSMUST00000057265 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Gm15599-201ENSMUST00000122283 1345 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Sgca-201ENSMUST00000100551 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 4930449E01Rik-202ENSMUST00000188698 532 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Ift22-204ENSMUST00000200153 670 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Gm45847-201ENSMUST00000209402 1880 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Gm39348-201ENSMUST00000216861 640 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Gm16439-201ENSMUST00000100687 564 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Gm11951-201ENSMUST00000116005 431 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 n-R5s154-201ENSMUST00000122513 108 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 1010001N08Rik-202ENSMUST00000181316 728 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Mettl7b-201ENSMUST00000026398 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Gm9790-201ENSMUST00000054148 288 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Gm24161-201ENSMUST00000104592 130 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Fhl1-206ENSMUST00000116596 1203 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Samd13-201ENSMUST00000124931 905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Gm27383-201ENSMUST00000184418 361 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 AC122459.4-201ENSMUST00000228654 551 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Zzef1Q5SSH7 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Zzef1Q5SSH7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Zzef1Q5SSH7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Zzef1Q5SSH7 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Zzef1Q5SSH7 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Zzef1Q5SSH7 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Zzef1Q5SSH7 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Zzef1Q5SSH7 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Zzef1Q5SSH7 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Zzef1Q5SSH7 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Zzef1Q5SSH7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Zzef1Q5SSH7 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Zzef1Q5SSH7 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Zzef1Q5SSH7 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms