Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
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Trappc1Q5NCF2 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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Trappc1Q5NCF2 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Lpin3-201ENSMUST00000040872 3458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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Trappc1Q5NCF2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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Trappc1Q5NCF2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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Trappc1Q5NCF2 Wdfy3-201ENSMUST00000053177 14274 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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Trappc1Q5NCF2 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
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Trappc1Q5NCF2 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
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Trappc1Q5NCF2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
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Trappc1Q5NCF2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
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Trappc1Q5NCF2 Gm26797-202ENSMUST00000213132 2562 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
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Trappc1Q5NCF2 Has3-201ENSMUST00000034385 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
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Trappc1Q5NCF2 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
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Trappc1Q5NCF2 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
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Trappc1Q5NCF2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC8.17□□□□□ -1.1
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