Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Znf608Q56A10 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Tulp2-203ENSMUST00000107758 1597 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Gm24161-201ENSMUST00000104592 130 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Tnnt3-204ENSMUST00000105942 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Tnnt3-207ENSMUST00000105945 747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Gm11521-201ENSMUST00000143302 329 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Znf608Q56A10 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Znf608Q56A10 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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Znf608Q56A10 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Znf608Q56A10 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Znf608Q56A10 Snx10-202ENSMUST00000114439 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Znf608Q56A10 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Znf608Q56A10 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Znf608Q56A10 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Znf608Q56A10 4933428M09Rik-201ENSMUST00000113046 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Znf608Q56A10 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Znf608Q56A10 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Pvalb-202ENSMUST00000120592 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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