Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm28047Q3US59 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm28047Q3US59 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm28047Q3US59 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm28047Q3US59 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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