Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Otud5Q3U2S4 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Otud5Q3U2S4 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Otud5Q3U2S4 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Otud5Q3U2S4 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Otud5Q3U2S4 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Otud5Q3U2S4 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Otud5Q3U2S4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Otud5Q3U2S4 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Otud5Q3U2S4 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Otud5Q3U2S4 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Otud5Q3U2S4 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Otud5Q3U2S4 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Otud5Q3U2S4 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Otud5Q3U2S4 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Otud5Q3U2S4 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Otud5Q3U2S4 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Otud5Q3U2S4 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Otud5Q3U2S4 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Otud5Q3U2S4 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Otud5Q3U2S4 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Otud5Q3U2S4 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Otud5Q3U2S4 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Otud5Q3U2S4 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Otud5Q3U2S4 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Otud5Q3U2S4 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Otud5Q3U2S4 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Otud5Q3U2S4 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Otud5Q3U2S4 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Otud5Q3U2S4 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Otud5Q3U2S4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Otud5Q3U2S4 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Otud5Q3U2S4 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Otud5Q3U2S4 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Otud5Q3U2S4 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Otud5Q3U2S4 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Otud5Q3U2S4 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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