Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Rnf149Q3U2C5 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Rnf149Q3U2C5 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Rnf149Q3U2C5 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Rnf149Q3U2C5 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Rnf149Q3U2C5 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Rnf149Q3U2C5 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Rnf149Q3U2C5 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Rnf149Q3U2C5 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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