Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Ccndbp1Q3TVC7 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Ccndbp1Q3TVC7 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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