Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

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Length 882 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10425-201ENSMUST00000181085 3364 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gtf3c3Q3TMP1 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Ovgp1-201ENSMUST00000000573 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gtf3c3Q3TMP1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gtf3c3Q3TMP1 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gtf3c3Q3TMP1 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Gtf3c3Q3TMP1 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gtf3c3Q3TMP1 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gtf3c3Q3TMP1 Ilf3-213ENSMUST00000216892 3684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gtf3c3Q3TMP1 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm19445-201ENSMUST00000193649 2438 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gtf3c3Q3TMP1 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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