Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ttc39dQ0VF76 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms