Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Siah1bQ06985 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms