Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Pde1bQ01065 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Pde1bQ01065 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Pde1bQ01065 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms