Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itga4Q00651 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms