Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmsP97355 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmsP97355 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmsP97355 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmsP97355 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmsP97355 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmsP97355 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmsP97355 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmsP97355 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmsP97355 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmsP97355 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmsP97355 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmsP97355 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmsP97355 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmsP97355 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmsP97355 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SmsP97355 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms