Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms