Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Opn1swP51491 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Opn1swP51491 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Opn1swP51491 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Opn1swP51491 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Opn1swP51491 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Opn1swP51491 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Opn1swP51491 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Opn1swP51491 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Opn1swP51491 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Opn1swP51491 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Opn1swP51491 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Opn1swP51491 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Opn1swP51491 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms