Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbrP50284 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbrP50284 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbrP50284 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbrP50284 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbrP50284 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Gm3159-203ENSMUST00000177764 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Elobl-201ENSMUST00000061938 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbrP50284 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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