Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VdrP48281 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Kng2-201ENSMUST00000039338 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm45509-201ENSMUST00000209624 1229 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VdrP48281 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VdrP48281 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VdrP48281 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VdrP48281 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VdrP48281 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VdrP48281 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VdrP48281 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VdrP48281 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VdrP48281 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VdrP48281 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VdrP48281 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VdrP48281 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
VdrP48281 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
VdrP48281 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VdrP48281 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VdrP48281 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VdrP48281 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VdrP48281 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms