Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprkP35822 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprkP35822 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprkP35822 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprkP35822 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprkP35822 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprkP35822 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprkP35822 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprkP35822 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprkP35822 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms