Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab20P35295 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab20P35295 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab20P35295 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab20P35295 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab20P35295 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab20P35295 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab20P35295 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab20P35295 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab20P35295 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab20P35295 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab20P35295 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab20P35295 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab20P35295 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab20P35295 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab20P35295 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab20P35295 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab20P35295 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab20P35295 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab20P35295 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab20P35295 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab20P35295 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab20P35295 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab20P35295 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab20P35295 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab20P35295 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab20P35295 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms