Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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