Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxraP28700 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RxraP28700 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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RxraP28700 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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RxraP28700 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxraP28700 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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