Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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PdgfraP26618 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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PdgfraP26618 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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PdgfraP26618 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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PdgfraP26618 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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PdgfraP26618 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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PdgfraP26618 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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PdgfraP26618 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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PdgfraP26618 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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PdgfraP26618 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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