Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms