Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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